| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第15-32页 |
| 1.1 番茄果实及其发育和成熟过程 | 第15-16页 |
| 1.2 番茄心室胶状物的形成及其功能 | 第16-20页 |
| 1.2.1 番茄心室胶状物的形成和发育过程 | 第17-18页 |
| 1.2.2 番茄心室胶状形成和发育过程中的细胞结构变化 | 第18页 |
| 1.2.3 番茄心室胶状物的分化特征 | 第18页 |
| 1.2.4 番茄心室胶状物的作用与功能 | 第18-20页 |
| 1.3 水解酶类在心室胶状物形成和发育过程中的作用 | 第20-22页 |
| 1.3.1 PG对心室胶状物形成和发育的影响 | 第20-21页 |
| 1.3.2 PME对心室胶状物形成和发育的影响 | 第21页 |
| 1.3.3 半乳糖苷酶对心室胶状物形成和发育的影响 | 第21页 |
| 1.3.4 其它酶类对心室胶状物形成和发育的影响 | 第21-22页 |
| 1.4 植物激素在心室胶状物形成和发育过程中的作用 | 第22-25页 |
| 1.4.1 乙烯对心室胶状物形成和发育的影响 | 第22-24页 |
| 1.4.2 生长素和赤霉素对心室胶状物形成和发育的影响 | 第24-25页 |
| 1.4.3 其它植物激素对心室胶状物形成和发育的影响 | 第25页 |
| 1.5 核内复制在心室胶状物形成和发育过程中的作用 | 第25-27页 |
| 1.5.1 番茄心室胶状物的核内复制 | 第25-26页 |
| 1.5.2 细胞周期素依赖蛋白激酶对心室胶状物核内复制的影响 | 第26-27页 |
| 1.5.3 其它酶类对心室胶状物核内复制的影响 | 第27页 |
| 1.6 心室胶状物相关的基因表达调控 | 第27-28页 |
| 1.6.1 心室胶状物相关的基因表达 | 第27-28页 |
| 1.6.2 转录因子对心室胶状物形成和发育的影响 | 第28页 |
| 1.7 DNA甲基化对心室胶状物形成和发育的影响 | 第28-29页 |
| 1.8 心室胶状物与果实的遗传进化 | 第29页 |
| 1.9 本研究的目的和意义 | 第29-31页 |
| 1.10 技术路线图 | 第31-32页 |
| 第二章 番茄全果肉性状的遗传分析与形态分析 | 第32-41页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-34页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第32页 |
| 2.1.2 遗传群体构建 | 第32-33页 |
| 2.1.3 形态学观察 | 第33页 |
| 2.1.4 石蜡切片制作 | 第33-34页 |
| 2.2 结果与分析 | 第34-39页 |
| 2.2.1 不同发育时期全果肉番茄与普通番茄果实心室组织的形态变化 | 第34页 |
| 2.2.2 番茄全果肉性状的遗传分析 | 第34-36页 |
| 2.2.3 心室组织的细胞结构差异 | 第36-39页 |
| 2.2.3.1 普通番茄心室组织与胎座、果皮及心室隔膜的细胞差异 | 第36-37页 |
| 2.2.3.2 全果肉番茄心室组织与胎座、果皮及心室隔膜的细胞差异 | 第37-38页 |
| 2.2.3.3 全果肉番茄与普通番茄心室组织的细胞差异 | 第38-39页 |
| 2.3 讨论 | 第39-41页 |
| 2.3.1 全果肉番茄与普通番茄心室组织的形态与细胞结构差异 | 第39-40页 |
| 2.3.2 番茄全果肉性状对种子发育的影响 | 第40-41页 |
| 第三章 番茄全果肉性状的全基因组关联分析 | 第41-47页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第41页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第41-42页 |
| 3.2 结果与分析 | 第42-45页 |
| 3.2.1 加工番茄核心种质的构建与低倍重测序 | 第42-43页 |
| 3.2.2 番茄叶片叶脉性状的关联分析 | 第43-44页 |
| 3.2.3 番茄花瓣颜色的关联分析 | 第44页 |
| 3.2.4 番茄果实全果肉性状的关联分析 | 第44-45页 |
| 3.3 讨论 | 第45-47页 |
| 第四章 番茄全果肉性状的BSA-Seq分析与遗传定位 | 第47-65页 |
| 4.1 材料与方法 | 第47-50页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第47-48页 |
| 4.1.2 遗传群体构建 | 第48页 |
| 4.1.3 BSA混池测序与分析方法 | 第48-49页 |
| 4.1.4 遗传连锁分析方法 | 第49-50页 |
| 4.2 结果与分析 | 第50-63页 |
| 4.2.1 BSA-Seq分析 | 第50-53页 |
| 4.2.1.1 测序样本的数据量与质量汇总 | 第50页 |
| 4.2.1.2 测序比对结果统计 | 第50-52页 |
| 4.2.1.3 BSA-Seq预测番茄全果肉基因定位 | 第52-53页 |
| 4.2.2 全果肉基因的遗传连锁分析 | 第53-63页 |
| 4.2.2.1 定位区域分子标记的开发 | 第53-57页 |
| 4.2.2.2 番茄全果肉基因的遗传连锁作图 | 第57-60页 |
| 4.2.2.3 定位区间候选基因分析 | 第60-63页 |
| 4.3 讨论 | 第63-65页 |
| 4.3.1 番茄狭窄的遗传背景影响BSA-seq定位 | 第63页 |
| 4.3.2 番茄全果肉基因的定位 | 第63-65页 |
| 第五章 差异表达基因分析与候选基因获得 | 第65-80页 |
| 5.1 材料与方法 | 第65-67页 |
| 5.1.1 试验材料与样本处理 | 第65页 |
| 5.1.2 试验方法 | 第65-67页 |
| 5.2 结果与分析 | 第67-76页 |
| 5.2.1 转录组测序结果与分析 | 第67-74页 |
| 5.2.1.1 转录组测序质量与组装分析 | 第67-69页 |
| 5.2.1.2 Reads在基因组上的分布 | 第69页 |
| 5.2.1.3 基因表达丰度分析 | 第69-70页 |
| 5.2.1.4 全果肉番茄与普通番茄心室组织的差异表达基因GO分析 | 第70-71页 |
| 5.2.1.5 全果肉番茄与普通番茄心室组织的差异表达基因KEGG分析 | 第71-72页 |
| 5.2.1.6 定位区域的差异表达基因 | 第72-74页 |
| 5.2.2 果实发育过程中差异表达基因的转录表达特征分析 | 第74-76页 |
| 5.3 讨论 | 第76-80页 |
| 5.3.1 心室胶状物的形成对代谢的影响 | 第76-79页 |
| 5.3.2 候选基因的获得 | 第79-80页 |
| 第六章 候选基因分析 | 第80-94页 |
| 6.1 材料与方法 | 第80-81页 |
| 6.1.1 试验材料 | 第80页 |
| 6.1.2 试验方法 | 第80-81页 |
| 6.2 结果与分析 | 第81-91页 |
| 6.2.1 候选基因的序列变异分析 | 第81-84页 |
| 6.2.1.1 缺失序列的分子标记检测 | 第81-83页 |
| 6.2.1.2 可用于番茄全果肉性状辅助选育的分子标记 | 第83页 |
| 6.2.1.3 缺失序列顺式作用元件分析 | 第83-84页 |
| 6.2.2 候选基因Solyc06g064840的蛋白序列结构 | 第84-86页 |
| 6.2.3 Solyc06g064840的蛋白序列同源性分析 | 第86-89页 |
| 6.2.3.1 Solyc06g064840与番茄中AG蛋白同源性比较 | 第86页 |
| 6.2.3.2 Solyc06g064840与其他植物中AGL蛋白同源性比较 | 第86-89页 |
| 6.2.4 系统进化分析 | 第89-91页 |
| 6.2.4.1 Solyc06g064840与番茄中AG蛋白的系统进化分析 | 第89页 |
| 6.2.4.2 Solyc06g064840与其它植物中AGL蛋白的系统进化分析 | 第89-91页 |
| 6.3 讨论 | 第91-94页 |
| 6.3.1 AGAMOUS家族的基因特征与功能 | 第91页 |
| 6.3.2 D类基因在番茄等肉质果实发育中的功能 | 第91-92页 |
| 6.3.3 Solyc06g064840的基因功能分析 | 第92-94页 |
| 第七章 全文总结与下一步工作计划 | 第94-96页 |
| 参考文献 | 第96-108页 |
| 附录 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 作者简历 | 第110-111页 |
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