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胡杨异形叶全基因组关联分析
 
     论文目录
 
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
引言第13-15页
1 植物叶形遗传调控研究进展第15-29页
    1.1 植物叶形研究进展第15-16页
    1.2 异形叶的研究进展第16-18页
    1.3 胡杨异形叶的研究进展第18-21页
        1.3.1 形态结构研究第19-20页
        1.3.2 生理研究第20页
        1.3.3 激素研究第20页
        1.3.4 蛋白质组学研究第20-21页
        1.3.5 基因分子功能研究第21页
    1.4 全基因组关联分析第21-24页
        1.4.1 传统GWAS分析第22-23页
        1.4.2 基于叶片轮廓的GWAS分析第23-24页
    1.5 GWAS分析的后续研究进展第24-27页
        1.5.1 上位效应第25-26页
        1.5.2 基因网络构建第26-27页
    1.6 研究目的和意义第27页
        1.6.1 研究目的第27页
        1.6.2 研究意义第27页
    1.7 研究内容和技术路线第27-29页
        1.7.1 研究内容第27-28页
        1.7.2 技术路线第28-29页
2 胡杨自然群体的群体结构第29-35页
    2.1 实验材料第29-32页
        2.1.1 采样地概况第29页
        2.1.2 植物材料第29页
        2.1.3 样品采集第29-30页
        2.1.4 DNA提取第30-31页
        2.1.5 群体SNP鉴定和筛选第31-32页
        2.1.6 群体结构分析第32页
    2.2 结果与分析第32-34页
        2.2.1 SNP标记第32页
        2.2.2 群体结构第32-34页
    2.3 讨论第34页
    2.4 小结第34-35页
3 叶片形态分析第35-49页
    3.1 分析方法第35-40页
        3.1.1 轮廓信息提取第35-36页
        3.1.2 轮廓分析第36-38页
        3.1.3 谐波级数第38页
        3.1.4 叶片形态的均值向量第38-39页
        3.1.5 方差分析第39页
        3.1.6 四个部位叶片形态之间的调控关系第39页
        3.1.7 聚类分析第39-40页
    3.2 结果与分析第40-46页
        3.2.1 谐波级数第40-42页
        3.2.2 方差分析第42-45页
        3.2.3 四个部位叶片形态之间的调控关系第45页
        3.2.4 聚类结果第45-46页
    3.3 讨论第46-47页
        3.3.1 椭圆傅里叶方法及谐波级数第46页
        3.3.2 叶片形态方差分析第46-47页
    3.4 小结第47-49页
4 胡杨叶片相关定量性状的GWAS分析第49-79页
    4.1 方法第49-51页
        4.1.1 模型设计第49-50页
        4.1.2 假设检验第50-51页
    4.2 结果与分析第51-63页
        4.2.1 影响叶片长度的显著SNP第55-56页
        4.2.2 影响叶片宽度的显著SNP第56-57页
        4.2.3 影响叶片长宽比的显著SNP第57-58页
        4.2.4 影响叶片面积的显著SNP第58-59页
        4.2.5 GO注释结果第59-63页
    4.3 讨论第63-66页
        4.3.1 影响叶片定量性状的显著SNP第63-64页
        4.3.2 GO注释结果第64页
        4.3.3 影响叶片定量性状发育的候选基因第64-66页
    4.4 小结第66-79页
5 胡杨叶片形态的GWAS分析第79-107页
    5.1 分析方法第79-83页
        5.1.1 模型设计第79-81页
        5.1.2 协方差矩阵的自回归模型第81-82页
        5.1.3 假设检验第82-83页
    5.2 结果与分析第83-90页
        5.2.1 影响四个部位叶片的显著SNP第83-84页
        5.2.2 影响异形叶性的显著SNP第84页
        5.2.3 GO注释结果第84-85页
        5.2.4 不同基因型值的叶片形态第85-90页
    5.3 讨论第90-94页
        5.3.1 显著SNP第90页
        5.3.2 GO注释结果第90-91页
        5.3.3 影响四个部位叶片形态发育的候选基因第91-93页
        5.3.4 影响异形叶性的候选基因第93-94页
    5.4 小结第94-107页
6 遗传效应第107-125页
    6.1 方法第107-110页
        6.1.1 QTL效应第107-108页
        6.1.2 遗传率第108页
        6.1.3 上位性模型第108-109页
        6.1.4 假设检验第109页
        6.1.5 两位点上位性效应第109-110页
    6.2 结果与分析第110-122页
        6.2.1 遗传效应第110-114页
        6.2.2 遗传率第114-116页
        6.2.3 SNP-SNP相互作用第116-117页
        6.2.4 上位性效应第117-122页
    6.3 讨论第122-123页
        6.3.1 基因效应的方向性第122页
        6.3.2 上位性与GWAS分析的比较第122-123页
    6.4 小结第123-125页
7 叶片形态的QTL调控网络第125-137页
    7.1 方法第125-128页
        7.1.1 QTL调控网络模型第125-126页
        7.1.2 动态效应曲线的勒让德平滑第126-127页
        7.1.3 邓巴定律和变量选择第127页
        7.1.4 微分方程的参数估计第127-128页
    7.2 结果与分析第128-134页
        7.2.1 平滑曲线阶数第128-129页
        7.2.2 四个部位叶片形态的QTL调控网络第129-130页
        7.2.3 异形叶性的QTL调控网络第130-134页
    7.3 讨论第134-135页
        7.3.1 QTL调控的双向性第134页
        7.3.2 不同QTL调控网络的比较第134-135页
        7.3.3 影响叶片形态发育的显著基因之间的调控关系第135页
    7.4 小结第135-137页
8 全文讨论第137-141页
9 结论与展望第141-145页
    9.1 结论第141-142页
    9.2 展望第142-145页
参考文献第145-171页
附录第171-213页
个人简介第213-215页
导师简介第215-217页
获得成果目录第217-219页
致谢第219-220页

 
 
论文编号BS4398609,这篇论文共220
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