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表示物种进化的LTR基因群绝大多数不在染色体DNA上
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一、rna+形式的ltr基因彼此离散地分布在细胞质、细胞核质的特定位置上
根据原核细胞到真核细胞呈现的进化顺序，将ltr基因调控的基因组及其产物划分为三大层次：第一大层次依序为核糖体、dna包装、细胞核骨架与核纤层以及细胞骨架，涉及核糖蛋白、组蛋白、非组蛋白与核纤层蛋白以及①微管、②微丝、③中等纤维与④微梁等相关基因组的表达；第二大层次依序为hox基因等、dna活化、rna剪接加工与mrna的翻译以及细胞周期、四类细胞通讯等相关基因组的表达；第三大层次依序为四种抑癌基因等、①核孔复合物、细胞色素和微体以及②热休克基因等、③磷酸酶等和④五大细胞质器等一系列基因组表达。
已经进化完备的ltr基因以rna+形式形成“类朊病毒颗粒”，后者与朊病毒等的组成成分相同，但不是病毒，不具有侵染性。在宿主细胞中，病毒能组装复制和扩散转移，“类朊病毒颗粒” 一般不能组装复制和扩散转移。“类朊病毒颗粒” 分布在自身调控的诸基因组产物中，决定了所在区域内物质分布的特异性。
待进化完善的ltr基因一般能相对稳定地分布在所调控的“末后层次基因组”的附近。若“末后层次基因组”隶属于第一大层次、第二大层次中的基因组，则ltr基因调控的相应的转座因子为dna转座子（dna transposon），尤其是ltr基因依进化顺序产生5种dna病毒—分别隶属于5个病毒科[2]，病毒基因组中ltr基因为dna形式。若“末后层次基因组”隶属于第三大层次中的基因组，则ltr基因调控的相应的转座因子为反转座子（retrotransposon）。
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