国家分配给内蒙古每年引用黄河水指标是５８．６亿ｍ³，内蒙古分配给河套灌区每年引用黄河水指标是４０亿ｍ³，而实际上灌区每年净引用黄河水５２亿ｍ³左右。内蒙古河套灌区引黄控制面积１１６万ｈｍ²，现有效灌溉面积５７万ｈｍ²，由内蒙古河套灌区管理总局负责管理，总局下设５个灌域管理局，负责灌溉、维护、收水费等日常工作。

　　灌域管理局下设有所、段，一般管到斗渠分水口。斗渠以下水费的收取原来由管理局委托村、乡负责，已经进行灌溉管理制度改革的地方，改由用水者协会或者由斗渠承包者负责灌溉和收水费。５个灌域管理局与其下属的所、段实行的是收支两条线，即所、段收水费多少与他们的经济利益不直接挂钩，所收水费全部上交，工资等其他开支另外由局拨付；而５个灌域管理局与总局是利益分成制，即所收水费５４％上交总局，４６％留给５个灌域管理局自己，用于人员工资开支、工程维护等等，这样的利益分成机制将对用水者协会等改革措施的进一步推广产生影响。