生物群落与生境的统一性是生态系统的基本特征。河流形态多样性是流域生态系统生境的核心，是生物群落多样性的基础。水利工程在不同程度上造成河流形态的改变，会降低生物群落多样性，影响河流生态系统的健康，从而使系统的服务功能下降，反过来损害人类的自身利益。在改进工程理念和开发新技术方法的前提下，水利工程建设应该在满足人类社会对水需求的同时，兼顾生态系统的健康需求。